依据史料和校友亲历以及海峡两岸清华大学校训同一的史实，清华的校训是“自强不息，厚德载物”应是不争之事实。然而，一段时间里，在网上出现多篇类似于“清华校训是16个字而非仅仅自强不息,厚德载物”“被腰斩的清华校训——独立精神,自由思想”的网文，称“清华校训之被腰斩,并非仅仅清华之悲哀,它标志着中国大学精神的迷茫和缺失”。 对此作为一个在清华学习工作生活了一个甲子，并从2002年开始研究清华历史文化的清华人，感到有必要澄清事实，以正视听。
所谓“独立精神,自由思想”应出自清华国学大师陈寅恪于1929年所撰写的纪念王国维的碑文：“惟此独立之精神，自由之思想，历千万祀，与天壤而同久，共三光而永光。”这离清华确立“自强不息，厚德载物”的校训已有十余年了，但“独立之精神，自由之思想”确是清华人的一种学术追求。
2014年颁布的《清华大学章程》明确写入“学术上倡导‘独立之精神，自由之思想’”。 现任校长邱勇提出了清华新百年“更创新，更国际，更人文”的办学理念，他认为大学负有文化传承创新之功能，应具备独特的思想品格和文化创造精神。
校训的现实体现
进入中国特色社会主义新时代后，国家加快了向创新性国家转型的步伐，清华也加大了蕴育创新文化的力度，学术氛围前所未有地活跃。学校无论从办学理念、教育思想或是学术研究正在逐步实现从跟随到并行甚至引领的跨越。
一批国际顶尖大学纷纷以对等的方式与清华联合办学，为了探索和应对世界性的挑战，培养创新人才，清华与华盛顿大学、微软公司联合创建的全球创新学院已在美国建成开学，以培养创新型的全球科技领袖和未来企业家为目标的清华-伯克利深圳学院也继而成立。清华学子在国际大学生超级计算机竞赛、国际无人机大赛、国际机器人抓取与操作比赛、中美青年创客大赛、大学生建筑设计竞赛和巴黎国际青年时装设计师大赛中勇夺冠军或金奖。在学术研究上，核能科学技术、放射检测技术、计算机科学技术、互联网技术、信息科学技术、现代制造技术、材料科学技术、脑机接口技术、密码破译技术、人脸识别技术、立体视频获取与重建技术、生物生命科学以及量子霍尔效应研究等等众多领域取得国际公认的领先成果。这些都是广大清华人依据“自强不息，厚德载物”“严谨、勤奋、求实、创新”“行胜于言”“人文日新”“独立之精神、自由之思想”等宝贵精神财富而取得的进步。
清华大学国际影响力逐年攀升，美国新闻与世界报道发布2019年全球佳大学排行榜，清华大学列第50名，亚洲第一名，工程类专业第3次蝉联世界第一名，2017年计算机科学与工程排名首次超越MIT，居世界榜首;英国QS全球高等教育集团发布2019年度的世界大学排名，清华大学名列第17名，《全球大学毕业生就业竞争力排名》位列世界第9;英国《泰晤士报高等教育专刊》公布2019年全球大学排行榜，清华位列第22名，学术声誉第14名。
尽管排行榜均有一定的片面性，但是，事实告诉我们没有必要“悲哀”，我们在不时进行文化自检的同时，正在倡扬充分的文化自信，我们的自信正是建立在客观的发展现实和清华人群体为此付出的主观努力上，包括对自身精神境界的不断追求和攀升上，这正是“自强不息 厚德载物” 校训魅力的现实体现。
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