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（一）疱疹样阿弗他溃疡应与原发性疱疹性口炎鉴别
原发性疱疹性口炎多发于婴幼儿，好发于牙龈、腭及唇黏膜，并有明显的发热、全身不适等前驱症状。其临床表现主要为在充血的黏膜表面出现多数粟粒大的水疱，密集成簇，或融合成片，破裂后遗留大小不等的糜烂面。血清学检查若发现抗HSV-I抗体滴度升高，更有助于疱疹性口炎诊断的建立医——学教育网搜集整理。
（二）重型阿弗他溃疡应与癌性溃疡、结核性溃疡和创伤性溃疡相鉴别
从年龄、性别、好发部位、溃疡特征、病理及全身情况等进行鉴别。
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