在《中国会计报》的7月3日与7月10的两期报道中已经提到，对于高新企业认定当中的各种问题，作为审计部门的国家审计署已经有所察觉，并提议科技部、财政部、国家税务总局等部门就高新技术企业的认定标准进行进一步的细化和明确，以规范相关企业的税收征管。
《中国会计报》近期独家获悉，财政部已将改革高新企业认定办法提上议事日程，开始着手做前期准备。不久前，科技部负责高新企业认定的火炬中心也会同科技部有关部门，分赴全国10个省市，就高新技术企业认定、政策落实与实施效果进行调研。
记者了解到，火炬中心还在近期开展了针对企业和认定机构的调查问卷，征集各方对认定工作尤其是认定办法本身的意见建议。在对认定机构的调查问卷中，首先调查的便是对新高新技术企业认定指标体系的评价，还包括了对研发费用总额占销售收入比例、科技人员和研发人员比例的评价以及对核心自主知识产权、科技成果转化能力、研发组织管理水平和成长性指标这四项指标的权重结构的评价等方面。
一位在地方科委长期从事高新企业认定工作的资深人士在接受《中国会计报》记者采访时透露，目前，财政、税收以及科技部门在对高新企业的认定条件上的确存在分歧，现有认定办法显然也有不完善的地方。“我们也在配合上级做调查工作，希望此次各部门能够达成一致，完善现有的认定办法。”
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