国税函[2009]221号文件为企业提供了在法人所得税制下对现实情况的一种应对方式。可以说，我国的法人所得税制目前还不能完全实施，对此种以总机构名义进行生产经营的非法人分支机构，又无法提供二级分支机构证明的，只能视同独立纳税人就地缴纳企业所得税。C项目部属于A公司派出的未领取非法人营业执照的分支机构，如其不符合二级分支机构的判断条件，该项目部以总机构名义进行工程承包经营，无法提供有效证据证明其二级及二级以下分支机构身份，应视同独立纳税人计算并就地缴纳企业所得税，不执行跨地区经营汇总纳税企业所得税征管办法，即不执行跨地区经营二级分支机构于当地预缴的办法，而应独立在项目所在地按年度分季或月预缴所得税，于年终汇算清缴。
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